Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrc49Q91YK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrc49Q91YK0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms