Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Trpm2Q91YD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpm2Q91YD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms