Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacng5Q8VHW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms