Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelenomQ8VHC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SelenomQ8VHC3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms