Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms