Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rprd1aQ8VDS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1aQ8VDS4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1aQ8VDS4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1aQ8VDS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rprd1aQ8VDS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms