Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgip1Q8VD37 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgip1Q8VD37 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms