Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef3Q8VCC8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef3Q8VCC8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef3Q8VCC8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms