Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms