Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc58Q8R3Q6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms