Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Rdh16f2Q8K3M1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rdh16f2Q8K3M1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Rdh16f2Q8K3M1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Rdh16f2Q8K3M1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rdh16f2Q8K3M1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rdh16f2Q8K3M1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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