Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm1Q8K377 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm1Q8K377 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms