Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms