Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc12Q8K2L8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc12Q8K2L8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms