Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Depp1Q8K2F3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms