Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Stx5Q8K1E0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Stx5Q8K1E0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms