Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scnm1Q8K136 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scnm1Q8K136 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms