Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbrd1Q8K0B2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms