Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrit1Q8K099 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit1Q8K099 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms