Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm17Q8JZX4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms