Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pnma3Q8JZW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms