Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rasgef1bQ8JZL7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms