Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip10Q8CJ53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms