Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nupl2Q8CIC2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms