Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NgefQ8CHT1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NgefQ8CHT1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms