Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nav1Q8CH77 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms