Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Upp2Q8CGR7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms