Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Parp11Q8CFF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Parp11Q8CFF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms