Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms