Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc178Q8CDV0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms