Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lancl3Q8CD19 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl3Q8CD19 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms