Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn3Q8CBC6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrn3Q8CBC6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms