Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spef2Q8C9J3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms