Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms