Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930504O13RikQ8C5Z9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms