Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ubqln3Q8C5U9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ubqln3Q8C5U9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ubqln3Q8C5U9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms