Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Amigo3Q8C2S7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo3Q8C2S7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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