Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc2Q8BZW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlrc2Q8BZW8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms