Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp38Q8BW70 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp38Q8BW70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Usp38Q8BW70 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp38Q8BW70 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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