Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssc5dQ8BV57 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssc5dQ8BV57 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms