Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gga3Q8BMI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gga3Q8BMI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms