Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc2Q8BKV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gpc2Q8BKV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms