Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnrc6bQ8BKI2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms