Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd4Q8BH32 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd4Q8BH32 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms