Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Timm29Q8BGX2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Timm29Q8BGX2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms