Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp4f39Q8BGU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp4f39Q8BGU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms