Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vipas39Q8BGQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Vipas39Q8BGQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vipas39Q8BGQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Vipas39Q8BGQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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