Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SynprQ8BGN8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms