Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
U2af1l4Q8BGJ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af1l4Q8BGJ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms