Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4bQ8BGE6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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