Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4bQ8BGE6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4bQ8BGE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms